W grudniu 2003 roku Spółka uzyskała certyfikat Zarządzania Jakością ISO 9001:2000 wydany przez RW TUV Polska.
W roku 2005 Spółka uzyskała Wyróżnienie w kategorii małych organizacji usługowych podczas XI edycji Konkursu Polskiej Nagrody Jakości. Nagroda ta została wręczona 11 listopada 2005 roku na zamku Królewskim w Warszawie.
26 listopada 2005r. Spółka odbierała przyznaną przez Izbę Przemysłowo-Handlową Rybnickiego Okręgu Przemysłowego Nagrodę Czarny Diament, która jest formą uhonorowania przedsiębiorstw za osiągnięcia gospodarcze, technologiczne, w ochronie środowiska, przeciwdziałaniu bezrobociu, wspieraniu inicjatyw społecznych i współpracy z samorządem terytorialnym
W maju 2006r. główna usługa Jastrzębskiej Spółki Kolejowej sp. z o.o. tj. udostępnienie linii kolejowych uzyskała nominację do Polskiego Godła Promocyjnego "Teraz Polska" w XVI edycji Konkursu na Najlepsze Produkty i Usługi
W roku 2006 Spółka uzyskała Wyróżnienie w kategorii średnich organizacji produkcyjnych i usługowych podczas XII edycji Konkursu Polskiej Nagrody Jakosci. Nagroda ta została wręczona 11 listopada 2006 roku na Zamku Królewskim w Warszawie
W kwietniu 2007 roku Spółka została laureatem VI edycji ogólnopolskiego konkursu LIDER INNOWACJI 2007 otrzymując stosowny certyfikat.
11 listopada 2007 roku Spółka została laureatem konkursu w kategorii małych organizacji usługowych podczas XIII edycji Polskiej Nagrody Jakości. Nagroda ta została wręczona na Zamku Królewskim w Warszawie.
19 stycznia 2008r. w Górnośląskim Centrum Kultury w Katowicach po raz szesnasty wręczone zostały Laury Umiejętności i Kompetencji. Jastrzębska Spółka Kolejowa Sp. z o.o. została uhonorowana Złotym Laurem w kategorii: udana restrukturyzacja.
5 grudnia 2008 r. w Sali Kongresowej Pałacu Kultury i Nauki w Warszawie podczas Wielkiej Gali "Przedsiębiorstwa Fair Play" odbyło się oficjalne ogłoszenie wyników całorocznej weryfikacji wszystkich firm zgłoszonych do uzyskania tytułu i certyfikatu "Przedsiębiorstwo Fair Play" 2008. Jastrzębska Spółka Kolejowa Sp. z o.o. otrzymała Certyfikat "Przedsiębiorstwo Fair Play" 2008.
9 stycznia 2009 r. JSK Sp. z o.o. otrzymała CERTYFIKAT honorowego medalu Izby Przemysłowo - Handlowej Rybnickiego Okręgu Przemysłowego.
W styczniu 2009 r. JSK Sp. z o.o. została nagrodzona Certyfikatem "Przejrzysta Firma" świadczącym o rzetelności w wywiązywaniu się z obowiązku publikacji sprawozdań finansowych.
W maju 2009 r. JSK Sp. z o.o. została laureatem konkursu - Lider Rynku 2009 Najlepsza w Polsce Firma - w zakresie zarządzania i udostępniania linii kolejowych na swoim obszarze działania .
27 maja 2011 roku JSK Sp. z o.o. została laureatem konkursu - Lider Rynku 2011 Najlepsza w Polsce Firma - w zakresie zarządzania i udostępniania linii kolejowych na swoim obszarze działania oraz laureatem konkursu Euro Leader w zakresie udostępnia linii kolejowych